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1994 : réflexion sur la création d’un Conservatoire botanique engagée par le Conseil départemental de la Haute-Loire.

1996 : création du Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique du Massif central. 

1997 : arrivée de l'équipe à Chavaniac-Lafayette (Haute-Loire).

1998 : 1er agrément du Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique national du Massif central (présidé par Jean Boyer) au titre de Conservatoire botanique national par le Ministère de l’aménagement du territoire et de l’environnement, en date du 10 juin 1998 et publié au Journal officiel de la République française le 7 juillet 1998.

2000 : création de l’antenne du Limousin à Limoges (Haute-Vienne).

2002 : adhésion de la Région Auvergne au Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique national du Massif central, par délibération des 16 et 17 décembre 2002 et par arrêté du Préfet de la Haute-Loire n° D.L.P.C.L./B5/2003/9 du 20 janvier 2003.

2003 : 2ème agrément du Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique national du Massif central (présidé par Madeleine Dubois) au titre de Conservatoire botanique national par le Ministère de l’écologie et du développement durable, en date du 26 décembre 2003 et publié au Journal officiel de la République française le 26 décembre 2003.

2010 : 3ème agrément du Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique national du Massif central (présidé par Robert Flauraud) au titre de Conservatoire botanique national par le Ministère de l’écologie, de l’énergie, du développement durable et de la mer, en date du 17 mai 2010 et publié au Journal officiel de la République française le 6 juillet 2010.

2010 : création de l’antenne de Rhône-Alpes à Pélussin (Loire).

2012 : adhésion de la Région Rhône-Alpes au Syndicat mixte pour la création et la gestion du Conservatoire botanique national du Massif central par délibération de la Région du 16 mai 2012 et par arrêté du Préfet de la Haute-Loire n°DIPPAL./B3/2012/113.

2012 : création de l’antenne Auvergne à Chavaniac-Lafayette (Haute-Loire).

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