Les herbiers du Conservatoire botanique contiennent actuellement 38 174 parts concernant en majorité le Massif central. Ils ont été constitués à partir de :

• l’herbier général du Conservatoire botanique (3 982 parts), contenant les récoltes des botanistes du Conservatoire botanique et de quelques legs;
• l’herbier d’Ernest Grenier (12 439 parts);
• l’herbier de Bernard Vigier (6 577 parts);
• l’herbier de Gérard Maret ( 4 668 parts);
• l’herbier du Frère Hildebert (2 407 parts);
• l’herbier de René Blache (1 919 parts);
• l’herbier de la Société linnéenne de Roanne (1 423 parts);
• l’herbier de Géraud Manhes (1 188 parts);
• l’herbier d’E. Hivert (806 parts);
• les herbier des écoles de Chaumont (63) (757 parts);
• l’herbier de E. Plantier (734 parts);
• l’herbier d’A. Popier (670 parts);
• l’herbier d’Hervé Lassagne (604 parts).

Un herbier de référence concernant les Bryophytes, riche d’environ 1 500 parts, est en cours de constitution depuis 2008. Il contient également quelques legs issus de différents herbiers. Tous les herbiers conservés au Conservatoire botanique sont informatisés et les informations contenues dans chacune des parts sont intégrées dans la base de données Chloris®. Le Conservatoire botanique a également analysé et informatisé plusieurs herbiers auxquels nous avons pu avoir accès :

• les herbiers conservés au Musée Crozatier du Puy-en-Velay ( 9 921 parts) et contenant entre autres les herbiers de Jean André Michel Arnaud, auteur de la Flore de la Haute-Loire (1825), de Louis-Marcellin Arnaud, son fils, d’Édouard Mathieu, d’Urbain Chastel, d’Edmond Moullade … Le dépouillement de ces herbiers a été réalisé par Maryse Tort qui a transmis au Conservatoire botanique les informations récoltées pour informatisation;
• les herbiers Lafay, Bazin, Alluaud et ceux de la Société des Sciences naturelles et archéologiques de la Creuse (2 500 parts) conservés au Musée de Guéret;
• les herbiers Le Gendre (environ 700 parts concernant des taxons patrimoniaux) et l’herbier de Christiane Descubes (environ 150 parts) conservés au Laboratoire de botanique de la Faculté de pharmacie de l’Université de Limoges;
• les herbiers de la Société des Sciences, Histoire et Archéologie de la Corrèze [Herbier Hippolyte Gay (390 parts) et Léonard Gribeaud (49 parts)], conservés au Musée Labenche de Brive;
• l’herbier Revol (4 622 parts en grande partie sur l’Ardèche) dont l’informatisation des étiquettes, réalisée par la Société botanique de l’Ardèche, a été intégrée dans Chloris®;
• une partie des herbiers de la Société linnéenne de Lyon [herbiers L. Boudet, U. Espine, A. Méhu (1836 parts)], dépouillés par les membres de la Société linnéenne de Lyon et intégrés dans Chloris®;
• quelques planches des herbiers de Bryophytes (Tourret, du Buysson, Dumas-Damon) et de certains Spermaphytes (Herbier général, d’Alleizette, Chassagne) des Herbiers universitaires de Clermont-Ferrand;
• quelques planches de l’herbier Lecoq conservé au Muséum d’Histoire Naturelle de Clermont-Ferrand;